Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd3Q61060 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms