Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RelnQ60841 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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