Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2cQ60772 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms