Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfaip3Q60769 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms