Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms