Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Csnk2a1Q60737 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Csnk2a1Q60737 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Csnk2a1Q60737 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csnk2a1Q60737 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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