Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms