Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SkiQ60698 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms