Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms