Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms