Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2aQ60648 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2aQ60648 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms