Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scaf1Q5U4C3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms