Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med13Q5SWW4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms