Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms