Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms