Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms