Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Utp18Q5SSI6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms