Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms