Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clhc1Q5M6W3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clhc1Q5M6W3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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