Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms