Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkaa1Q5EG47 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms