Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms