Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms