Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chsy3Q5DTK1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chsy3Q5DTK1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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