Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmtc2Q56A06 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmtc2Q56A06 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms