Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms