Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig2Q52KR2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms