Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otol1Q4ZJM7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms