Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms