Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm527Q4KL13 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms