Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC100530Q497J0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC100530Q497J0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms