Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx25Q3ZT31 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms