Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Carmil2Q3V3V9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms