Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ckap2Q3V1H1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap2Q3V1H1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms