Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnah12Q3V0Q1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnah12Q3V0Q1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms