Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rimbp3Q3V0F0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms