Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Usp48Q3V0C5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Usp48Q3V0C5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp48Q3V0C5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Usp48Q3V0C5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp48Q3V0C5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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