Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc27Q3V036 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms