Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3UZV7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3UZV7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms