Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm6Q3UZD5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm6Q3UZD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prdm6Q3UZD5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prdm6Q3UZD5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm6Q3UZD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms