Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms