Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fbQ3UWQ3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms