Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BB287469Q3UT53 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BB287469Q3UT53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms