Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms