Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsg1Q3UM18 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms