Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms