Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam83fQ3UKU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam83fQ3UKU4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms