Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc61Q3UJV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms