Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp19Q3UJD6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms