Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Greb1Q3UHK3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Greb1Q3UHK3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms